玄空即是时空，具体表现在元运上。元运者，三元九运也。有些玄空伪书，仍流传至今，说什么因八卦只有八个，相应地也只有八个运，而将五运分配至四运与六运中，此两个运各管三十年，其余运各管二十年，亦得一百八十年。此不明元运之由来，臆想出来的文学创作，实不足取。过路阴阳风水学中，用河图生成数，将元运所管之年缩小，即一六共宗、二七同道、三八为朋、四九为友、五十同途，一六运其管二十年，得一百年一循环。这是该学问对元运的规定，是否可取，待读者去研查。斗转星移，三元九运是太阳系木星与土星相会的产物。时间记时是由星球运行而产生。地球围绕太阳公转一周为一年。月球围绕地球公转一周为一月。地球自转一周为一日。
太阳系中最大的星球为木星，木星每十二年围绕太阳公转一周，每年所转到的方位是太岁方，故木星称为岁星。如2006年为丙戌年，太岁方在戌位。相应地岁冲（破）方在辰位，寅午戌三煞在北，即亥、子、丑方。用十二地支记录，每年太岁方。因木星（岁星）对地球发出的能量很大，故书有不能“在太岁头上动土有凶祸”之说。而体积仅次于木星的是土星，土星围绕太阳公转一周是三十年。这两大行星（木星、土星）每二十年相会一次，用以配九星，每运一个星，管二十年。以木星公转十二年和土星公转三十年的最小公倍数六十年，为一个甲子，即一个元，为六十年。一元为六十年，三元共一百八十年。一运为二十年，九运共一百八十年。三元者，上元一、二、三运，中元四、五、六运，下元七、八、九运。上元一白主事，中元四绿主事，下元七赤主事。每运二十年，都有一个管事之星，称之为令星、旺星、吉星。如2006年为丙戌年，下元八运，八白主事。
近世纪三元九运的时间分配如下：一九O四年至一九二三年，为上元三运。一九二四年至一九四三年，为中元四运。一九四四年至一九六三年，为中元五运。一九六四年至一九八三年，为中元六运。一九八四年至二OO三年，为下元七运。二OO四年至二O二三年，为下元八运。二O二四年至二O四三年，为下元九运。二O四四年至二O六三年，为上元一运。二O六四年至二O八三年，为上元二运。三元九运每一百八十年为一个循环，生生不息。玄空风水是将元运起星盘用以推断宅运的学问，为风水体系中理气的范畴，科学性很强。欲知宅运，须知此宅何年起造，便知何运何星主事。玄空风水学是将天时、地利、人和即三才（天、地、人）综合运算的学问。天者，天运、时运也。地者，地理位置、地理环境即地运也。人者，宅受天、地气场的影响反招于人运也。
三元九运：即60甲子为一元，每20年为一运，即一元有三运，若三元则九运，能管3*60=180年。这九运也各有名称：一白、二黑、三碧、四绿、五黄、六白、七赤、八白、九紫。分别对应卦象五行：坎水、坤土、震木、巽木、中土、乾金、兑金、艮土、离火。按说一元三运，即60甲子为循环就可以了，但为了配合八卦 中宫这9个位置，就让每个位置对应一运，于是有了九运。这样就升级为更大的循环区间：三元=九运=180年。因为三元九运这套体系是运用于风水方面的，所以要从风水学典籍去找源头。不过最早应来自战国的五行学说、八卦学说，到汉朝罢黜百家后，流入民间结合一体，成就了风水学。其实，如果按照黄帝元年（通行的是西元前2697年）即第一个上元甲子开始推三元九运，现在应该是二黑运。