脑干反射：音乐当中一种或多种声学上的基本特性被脑干捕获，脑干将此识别成一些值得注意的重要或紧急信息，生理节律与音乐节奏的"共鸣"：人体的一些生理节律（例如心律）在外部的音乐节奏/节拍影响下，和音乐同步。有过live经验的人对此应该有所体会，评价性条件反射：某些音乐在某个人的经历里总是和或正面或负面的其他刺激同时出现，这个人在听到相应的音乐时就会被引起相应的或正面或负面的情绪（可参考：经典条件反射），情绪传染：人感受到音乐所传递的情绪，继而将其内化（可参考：共情），视觉想像：这个很容易理解，听到音乐时联想到了一些视觉画面，就引起了和那些视觉画面相联系的情绪，情节记忆：音乐让人回忆起了关于自身的一些过往经历，引起了和这些经历相关的情绪，对音乐的期待：在一段音乐的行进当中，无论是符合了还是违反了听者对于音乐的期待，都有可能引起情绪。
神经科学方面，有不少研究表明听音乐能引起边缘系统的激活，而边缘系统和情绪有极为密切的关系。可以粗略比较下面两幅图，黑白图中的彩色点的分布和彩色图中的红色部分有重合。美国学者扬（Yung,1961）提出，情绪一种对正常生理、心理平衡的扰乱和破坏。”当人被周围情境激动到他的大脑控制减弱或失去控制的时候，这个人就有了情绪“海曼(Hohmann,1962)则提出，情绪是一种生理激活和生理能量的动员。情绪是对正常过程的破坏和中断。
我觉得任何一件音乐作品都包含，表达，甚至就是创作者当时身，心，灵的全部体验。当这个作品被重新播放或者演奏的时候，就好像那些体验的重现。对于听者来讲，他所接收到的也许是全部的信息。换句话说，音乐承载的信息量比较大，除了二元的，认知的信息以外，还有直觉的，情感的，潜意识的，超越二元的信息。也许是因为这样，音乐才可以如此强力地影响人的情绪（以及许多其他生理和心理的方面）。也许正因这样，我自己在琢磨到底是哪一个音乐元素影响了脑部的哪一个区域，又是哪一个音乐元素控制着人们什么样的期许这样的问题时，有一种无力感。所以感谢以上各位大师的细究。
和声、力度和节奏等因素在生理反应模式中本身具有先天的、生物程序的情绪功能，而旋律不同，它不具有先天的生理的情绪性质，它被整合的中枢部位是在大脑皮层，他的全部意义都依赖于大脑皮层的认知和评估作用。来自听觉神经的音高组织信号被传导到大脑。不同的音高产生不同的神经纤维输送到大脑皮层的不同部位，形成不同的音高体验。现代神经心理学研究已经证明，携带不同频率声音信号的神经纤维终止与大脑皮层的听觉中枢的不同部位。听觉中枢位于被称为”薛氏窝“的深沟中，高频信号终止在薛氏窝的深部，而低频音终止在外表面附件。